Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms