Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms