Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYTH4Q9UIA0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYTH4Q9UIA0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms