Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX1-2Q9UD57 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms