Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms