Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms