Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms