Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRPC4Q9UBN4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms