Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D2AQ9P2K1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D2AQ9P2K1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CC2D2AQ9P2K1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CC2D2AQ9P2K1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms