Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSU72Q9NP77 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms