Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPJQ9HC77 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms