Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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IFT27Q9BW83 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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