Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms