Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FYCO1Q9BQS8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms