Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIK3R4Q99570 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms