Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MYCBPQ99417 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms