Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NSMCE2Q96MF7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSMCE2Q96MF7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms