Protein–RNA interactions for Protein: Q96L73

NSD1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD1Q96L73 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
NSD1Q96L73 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NSD1Q96L73 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms