Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms