Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGF29Q96ES7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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