Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLIP3Q96DZ5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms