Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NXPE2Q96DL1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms