Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms