Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG4Q92954 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms