Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms