Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF248Q8NDW4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms