Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms