Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWN7

RP1L1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1L1Q8IWN7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RP1L1Q8IWN7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RP1L1Q8IWN7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RP1L1Q8IWN7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RP1L1Q8IWN7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RP1L1Q8IWN7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RP1L1Q8IWN7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RP1L1Q8IWN7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RP1L1Q8IWN7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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