Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms