Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC80Q76M96 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms