Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00299Q6ZSB3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms