Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms