Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms