Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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