Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms