Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMPD1Q5SYB0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms