Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms