Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCID2Q5JVF3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms