Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITRM1Q5JRX3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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