Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms