Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP28Q4G0W2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms