Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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