Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBPF1Q3BBV0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms