Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETM2Q2VYF4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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