Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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