Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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GEN1Q17RS7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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