Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCAQ16586 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms