Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZIC1Q15915 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZIC1Q15915 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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