Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VPS72Q15906 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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