Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SIX1Q15475 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIX1Q15475 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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